内阁首辅方从哲，次辅韩爌、三辅王象乾以及吏部尚书李汝华、礼部尚书孙如游、户部尚书汪应蛟、兵部尚书徐光启、刑部尚书黄克缵、工部尚书毕懋康在向朱由校行大礼后皆站在了朱由校的内书房外。
“你们今晚倒来的齐全。”
朱由校语气不好地回了一句，然后斜眼瞥了众臣一眼。
“启禀陛下，白天在有不懂事的士子在大闹锦衣卫大堂，此事我们都知道了，如今特来求见陛下的确是想求陛下开恩的，求陛下看在他们年少无知的份上不要与他们计较，网开一面吧。”
礼部尚书孙如游说了起来。
朱由校笑了起来：“年少无知？这些人里应该不少都已过而立之年了吧，去都察院大闹，朕可以理解他们无知，但去锦衣卫大堂闹，甚至还打死锦衣卫数名，这已经是谋反，是不把朕，不把朝廷放在眼里！下次，他们是不是还敢闯进午门，把朕也打死？”
“陛下息怒，这些士子的确罪大恶极，但他们毕竟是读书人，杀他们易，可要让天下人心从此诚服难啊，如今这事说到底还是因李三才之罪而起，这李三才虽也罪大恶极，但他的确于士林中很有威望，杀他就等同于不顾忌天下人心，不然，神庙当年为何不杀李三才，非不想而不能也！陛下，为大明千秋计，有些时候不能意气用事啊，社稷安宁非是以法治天下，而是以礼治天下，朝廷也应以礼待天下士，而非以法禁天下事，不然人心难服啊。”
吏部尚书李汝华也跟着说了起来。
朱由校听后只想起一句话来，那就是“儒以礼乱法”这句。
这时候，刑部尚书黄克缵甚至跪了下来：“陛下！老臣收回之前的话，如今这局面，还是不治李三才死罪，饶恕那些士子，以顺天下人心吧。”
“你们不必再劝！李三才是必须杀的，这些闹锦衣卫大堂的士子也是必须杀的！朕意已决！”
朱由校说着就又道：“拟旨，李三才处凌迟时再加五百刀！”
“陛下！”
黄克缵喊了一声，欲要再说话。
“要抗旨吗？”
朱由校语气森冷地问了一句。
“臣，臣遵旨！”
黄克缵最终还是回了一句。
而户部尚书汪应蛟见此不由得站了出来：“陛下，臣担心，这样下去，不说别的，只怕漕粮会断，天下逋赋增多，到时候九边和京师会因此发现断粮现象，而以致于军心民心